1996年，纽约斯隆凯特琳纪念癌症中心临床肿瘤学家Charles Sawyers主持一个针对癌细胞特异性基因突变的药物早期临床实验，这个药物的是imatinib(格列卫)，治疗的疾病是慢性淋巴细胞白血病。Sawyers的这次临床研究发现，这种药物治疗的效果非常理想。但不幸的是，一旦对这一药物产生耐受，肿瘤细胞再次卷土重来。

　　现在生物学家对恶性肿瘤比10年前了解的要多很多。目前，已经发现500个基因突变和恶性肿瘤发生有关，而且这个数字正在不断增加。针对基因突变已经获准上市的肿瘤治疗药物大约有100种，已经和手术切除和放射治疗一起成为治疗癌症的三种主要方法。这种新的治疗方法已经取得了比较理想的效果，恶性肿瘤死亡率增加趋势在一些地区已经受到一定程度的遏制。

　　大约50%的恶性肿瘤能通过改善生活饮食习惯和运动预防，戒烟和减少环境污染也十分重要。但是，为控制恶性肿瘤，科学家必须对一些基本的科学问题进行回答。

　　其中第一个问题就是如何对付癌细胞的耐药问题。为克服癌细胞耐药问题，科学家正在研究癌细胞基因组，提出新的药物设计方案，利用联合用药的办法，甚至从达尔文的进化论中寻找解决问题的智慧。

　　全面了解肿瘤细胞的基因多样性，也许能帮助科学家找到对付药物耐受的方法。因此，Swanton等科学家正在寻找更快更便宜的DNA测序技术。从目前掌握的数据看，肿瘤细胞似乎存在一组共同的基因突变类型。科学家现在正尝试研究肿瘤进化，通过这种研究或许能不需要基因序列测定就可以预测肿瘤进化方向，以协助提前调整治疗方案。

　　英国肿瘤研究院肿瘤学家Paul Workman的小组采用基因网络计算机模型对数千种可能药物组合和基因进行配对，寻找理想的药物配方。他认为，虽然药物联合治疗是目前控制药物耐受唯一可行的策略。但是开发新药物仍也十分必要。他估计，只有可怜的5%已知癌症基因有相应药物，另外95%的癌症基因并没有特异性药物，只有5%的子弹，如何消灭100%的敌人?联合治疗的基础现在仍不够坚实。

　　第二个问题是肿瘤微环境问题。一方面，大多数促进肿瘤发生的物理化学因素都能诱发基因突变，另一方面，确实有许多恶性肿瘤明确存在基因突变问题。但是恶性肿瘤的复杂性之一是恶性肿瘤周围正常组织对肿瘤的发生发展也具有协助作用，这不仅挑战人们对恶性肿瘤发生原因的理解，也给人们控制恶性肿瘤带来了困惑和麻烦。

　　麻省理工学院科赫癌症综合研究所Jacqueline Lees认为，只考虑直接杀伤癌细胞，而忽视造成细胞癌变的肿瘤微环境是不全面的，肿瘤和非肿瘤细胞，肿瘤和免疫系统之间存在相互作用，没有来自周围组织细胞微环境的支持，肿瘤并不能单独生存，而传统的药物研究完全忽视这一问题。

　　第三大谜团是肿瘤转移问题。流行病学调查表明，90%的肿瘤患者死于肿瘤转移。肿瘤转移的情况比较复杂，有的很快发生，有的很慢，甚至有时候在患者被确定治愈10年后再发生转移。因此深入理解肿瘤转移的机制将有利于寻找预防患者死亡的方法。

　　怀特海德生物医学研究所肿瘤生物学家Robert Weinberg认为，肿瘤开始转移的过程已经逐渐被认识。肿瘤生长过程一些细胞很活跃，能进入血液循环。进入血液循环的肿瘤细胞能在其他组织器官定居并形成新瘤体。这一过程最神秘的是这些细胞如何适应并在新环境生存下来。例如，脑组织和骨髓组织是和乳腺组织完全不同的组织类型，但肿瘤组织竟然能在这里生根发芽。在原发组织，肿瘤细胞可以获得生长因子、蛋白信号等支持性信息，转移瘤细胞如何获得这些支撑? 这些信号目前都不清楚，也没有太多学者研究这个问题。Chambers说，肿瘤休眠的研究比较枯燥棘手，就好象观察一面没有图象的白墙，科学家不喜欢研究没有变化的东西。